1977年12月30日，經(jīng)遼寧省編制委員會(huì)批準(zhǔn)，正式成立遼寧省中醫(yī)研究所，人員編制100名。1982年6月，遼寧省計(jì)劃委員會(huì)批準(zhǔn)建設(shè)一萬平方米的醫(yī)院，于1984年6月竣工。

     1984年3月，病房樓開始施工，于1986年9月竣工。在1987年6月，制劑室和職工食堂竣工投入使用后，基本建設(shè)完成，研究院的科研和醫(yī)療工作全面展開，步入新的發(fā)展階段。

    1985年11月，遼寧省中醫(yī)研究院臨床部改稱遼寧省中醫(yī)研究院附屬醫(yī)院，1986年9月2日正式掛牌開診。

    1990年成立了遼寧省中醫(yī)研究院鐵西門診。1993年成立了北市門診。1994年成立了太平門診。醫(yī)院的服務(wù)能力逐漸提升，影響力進(jìn)一步擴(kuò)大。

    1996年9月，醫(yī)院更名為遼寧省中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院，積極探索新的發(fā)展途徑。1997年3月，更名為遼寧中醫(yī)學(xué)院第二附屬醫(yī)院，隸屬關(guān)系由省衛(wèi)生廳劃歸遼寧中醫(yī)學(xué)院。1998年2月，廢止了遼寧省中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院的名稱。

    1999年率先在醫(yī)院建立名醫(yī)堂、養(yǎng)生康復(fù)中心，提升醫(yī)院急診搶救和綜合服務(wù)能力。2003年遼寧省中醫(yī)研究院更名為遼寧省中醫(yī)藥研究院，進(jìn)一步堅(jiān)持中醫(yī)中藥并重，彰顯科研實(shí)力。

2006年，因大學(xué)更名，醫(yī)院更名為遼寧中醫(yī)藥大學(xué)附屬第二醫(yī)院。2008年11月，新病房大樓正式開工建設(shè)，標(biāo)志著醫(yī)院發(fā)展進(jìn)入了一個(gè)新的歷史時(shí)期。

“擴(kuò)建門診病房科研教學(xué)綜合樓”項(xiàng)目入選國家發(fā)改委和國家中醫(yī)藥管理局“十三五”中醫(yī)藥傳承創(chuàng)新工程的2018年度衛(wèi)生領(lǐng)域中央投資計(jì)劃建設(shè)項(xiàng)目。2018年8月，項(xiàng)目正式開工。2020年新綜合樓正式竣工并投入使用，為醫(yī)院發(fā)展奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。